朝廷，官品也不一定比布政使、按察使。后来地方问题越来越多，尤其是军事、防务上越来越吃紧，巡抚就逐渐从临时变成定例，最终成为一省的军政司法最高长官。相应地，巡抚的官品一般为正二品，而布政使和按察使的官品下调为正三品，成为巡抚的属官。
按照朱由检的理解，如果拿前世的官员名目往这里套的话，巡抚就大致相当于省委书记，布政使相当于省长，按察使相当于省法院院长、检察院检察长，都指挥使相当于军分区司令。一个巡抚管着这么多部门，权力是相当大了。而实际还不至于此，就拿河南巡抚来说，官职的全称是“巡抚河南等处地方 提督军务粮饷 兼理河道屯田 兼兵部右侍郎 兼都察院右副都御史”，光是念出来已经很吓人了。
然而不管是巡抚、布政使、按察使还是都指挥使，都是高高在上的官老爷。真正与普通老百姓打j道的，还是府县官员，尤其是县官。这一点朱由检在泾y县就知道了，明代县级官府的特点是有官有吏，官少吏多；名义上官大于吏，实际上吏“绑架”官。
具地说，一个县的“朝廷命官”只有五位：知县，正七品；县丞，正八品；主簿，正九品；典史，未如流；教谕，未如流。
但是很显然一个县只靠五个人治理是根本不可能的，所以官下面还有吏，也就是衙门里的其他人员。按照设计这个制度时最初的构想，吏也属于民，不在朝廷的官员编制之中
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